Organisasi Otonom ialah organisasi yang dibentuk oleh Muhammadiyah yang memiliki wewenang mengatur rumah tangganya sendiri, dengan bimbingan dan pembinaan oleh Pimpinan Muhammadiyah. Organisasi otonom bisa berbentuk organisasi otonom umum ataupun organisasi otonom khusus. Organisasi Ortonom memiliki struktur sebagaimana Muhammadiyah, dari tingkat desa sampai pusat, yang pembentukkannya ditetapkan oleh Tanwir Muhammadiyah.

ORGANISASI OTONOM MUHAMMADIYAH

AISYIYAH , Ketua PDA BONTANG : Hj. ZULIANI RUSIDA

Bergerak di kalangan wanita, merupakan gerakan Islam dan amar ma'ruf nahi munkar, berakidah Islam dan bersumber Al-Qur'an dan Sunnah. Tujuan didirikannya adalah untuk menegakkan dan menjunjung tinggi agama Islam sehingga terwujudnya masyarakat utama, adil, dan makmur yang diridhai Allah dengan upaya-upaya sebagai berikut: Meningkatkan harkat dan martabat kaum wanita menurut ajaran Islam. Membimbing kaum wanita ke arah kesadaran beragama dan berorganisasi. Membimbing angkatan muda supaya menjadi orang Islam yang berguna bagi agama, bangsa, dan negara. Memperteguh iman, menggembirakan, dan memperkuat ibadah serta mempertinggi akhlaq. Mempergiat dan menggembirakan dakwah Islam serta mar ma'ruf nahi munkar. Memajukan dan meningkatkan pendidikan, pengajaran, dan kebudayaan, serta memperluas ilmu pengetahuan menurut ajaran agama Islam. Menggerakkan dan menghidupsuburkan amal tolong-menolong dalam kebajikan dan ketaqwaan. Membimbing ke arah perbaikan kehidupan dan penghidupan yang sesuai dengan ajaran agama Islam. Mendirikan, memakmurkan, dan memelihara tempat-tempat ibadah dan wakaf. Menanamkan kesadaran beramal agar ajaran Islam berlaku dalam masyarakat. Mempergiat dan memperdalam penyelidikan ilmu agama Islam untuk mendapatkan kemurniannya. Memantapkan persaudaraan dan kesatuan bangsa dan peran serta dalam pembangunan nasional. Melakukan usaha-usaha lain yang ssesuai dengan tujuan organisasi

NASYIATUL AISYIYAH, Ketua PD NA : HASNA

Merupakan gerakan putri Islam yang bergerak dibidang keagamaan, kemasyarakatan, dan keputrian. Tujuan didirikannya adalah untuk membentuk putri Islam yang berarti bagi keluarga, bangsa, dan agama menuju terbentuknya masyarakat Islam yang sebenar-benarnya, dengan upaya-upaya sebagai berikut: Menanamkan Al-Islam yang bersumber kepada Al-Qur'an dan Hadits sesuai dengan jiwa Muhammadiyah kepada anggota-anggotanya sebagai dasar pendidikan dan pedoman berjuang. Meningkatkan pendidikan bagi anak-anak dan kaum remaja maupun anggota Nasyiatul Aisyiyah untuk membentuk kepribadian muslim sehingga menjadi uswatun hasanah bagi kehidupan masyarakat. Mendidik anggota-anggotanya menjadi mubalighat yang baik. Meningkatkan fungsi dan peranan Nasyiah sebagaai pelopor, pelangsung, dan penyempurna perjuangan Muhammadiyah. Mendidik dan membina kader-kader pimpinan untuk kepentingan agama, organisasi, dan masyarakat ke arah sumber daya manusia yang lebih berkualitas. Mendidk anggota-anggota untuk mengembangkan ketrampilan dan keaktifannya sebagai seorang putri Islam serta mengamalkannya sesuai tuntunan Islam. Mengembangkan jiwa wira usaha dan kegiatan pengembangan ekonomi untuk mewujudkan kekuatan ekonomi umat yang tangguh. Menggerakkan usaha-usaha penyuluhan untuk meningkatkan kesadaran akannilai-nilai moral, HAM, demokrasi, hjukum, dan perdamaian dengan pesan luhur ajaran Islam. Meningkatkan kegiatan keilmuan yang berkelanjutan untuk mengembangkan tradisi ilmiah di kalangan anggota, umat, dan masyarakat. Mengembangkan usaha-usaha pencerahan dan pemberdayaan sesua dengan nilai-nilai ajaran Islam. Membina ukhuwah Islamiyah dan meningkatkan dakwah amar makruf nahi munkar. Mengembangkan kerja sama dengan berbgai pihak yang mengarah pada perdamaian, kebaikan, ketaqwaan, dan menuju terwujudnya tata kehidupan rahmatan lil 'alamin

PEMUDA MUHAMMADIYAH , Ketua: BUSTANUL ARIFIN, S.E.

Bergerak di kalangan pemuda, merupakan gerakan Islam dan amar ma'ruf nahi munkar di kalangan muda, berakidah Islam dan bersumber Al-Qur'an dan Sunnah. Tujuan didirikannya adalah untuk menghimpun, membina, dan menggerakkan potensi Pemuda Islam serta meningkatkan perannya sebagai kader untuk mencapai tujuan Muhammadiyah dengan upaya-upaya sebagai berikut: Meningkatkan iman dan taqwa kepada Allah SWT. Memperdalam ilmu dan memperluas pengetahuan dan meningkatkan kecerdasan serta mengamalkan sesuai dengan ajaran Islam Memperdalam dan meningkatkan pemahaman agama Islam. Menyelenggarakan dan meningkatkan mutu pendidikan kader. Mengadakan dakwah di kalangan pemuda dan remaja. Meningkatkan fungsi dan peran pemuda muhammadiyah sebagai kader Muhammadiyah, kade umat Islam, dan kader bangsa. Memasyarakatkan dan meningkatkan kegiatan olahraga sebagai sarana dakwah Islamiyah. menumbuhkan dan mengembangkan seni budaya yang bernafaskan Islam. Menggembirakan beramal yang diridhai Allah dan hidup tolong-menolong(ta'awun) dalam ukhuwah Islamiyah. Usaha-usaha lain yang tidak menyalahi tujuan muhammadiyah.

IKATAN PELAJAR MUHAMMADIYAH (IPM), Ketua : IMAM

Merupakan gerakan Islam dan amar ma'ruf nahi munkar di kalangan muda, berakidah Islam dan bersumber Al-Qur'an dan Sunnah. Tujuan didirikannya adalah untuk membentuk remaja muslim yang berakhlaq muliadalam rangka menegakkan dan menjunjung tinggi sehingga terwujud masyarakat utam yang adil, makmur yang diridhai Allah, dengan upaya-upaya sebagai berikut: Menanamkan kesadaran beragama Islam, memperteguh iman, menertibkan peribadatan, dan mempertinggi akhlak. Mempergiat dan memperdalampemahaman agama Islam untuk mendapatkan kemurnian dan kebenarannya. Memperdalam, memajukan, dan meningkatkan ilmu pengetahuan, teknologi dan budaya. Membimbing, membina, dan menggerakkan anggota guna meningkatkan fungsi dan peran IRM sebagai kader persyarikatan, umat, dan bangsa dalam menunjang pembangunan manusaiseutuhnya menuju terbentuknya masyarakat utama, adil, dan makmur yang diridhai Allah. Meningkatkan amal shalih dan kepedulian terhadap nilai-nilai kemanusiaan. Segala usaha yang tidak menyalahi ajaran Islam dengan mengindahkan hukumdan falsafah yang berlaku.

IKATAN MAHASISWA MUHAMMADIYAH (Ketua : ASEP GUMELAR) /b>

Merupakan gerakan mahasiswa Islam yang bergerak dibidang keagamaan, kemasyarakatan, dan kemahasiswaan. Tujuan didirikannya adalah mengusahakan terbentuknya akademisi Islam yang berakhlaq mulia dalam rangka mencapai tujuan Muhammadiyah, dengan upaya-upaya sebagai berikut: Membina para anggota menjadi kader persyarikatan Muhammadiyah, kader umat, dan kader bangsa yang senantiasa setia kepada keyakinan dan cita-citanya Membina para anggota agar selalu tertib dalam ibadah, tekun dalam studi, dan mengamalkan ilmu pengetahuannya untuk melaksanakan ketaqwaannya dan pengabdiannya kepada Allah SWT. Membantu para anggota khususnya dan mahasiswa pada umumnya dalam menyelesaikan kepentingannya. Mempergiat, mengefektifkan, dan menggembirakan dakwah Islam dan dakwah amar ma'ruf nahi munkar kepada masyarakat, khususnya masyarakat mahasiswa. Segala usaha yang tidak menyalahi azas gerakan dan tujuan organisasi dengan mengindahkan segala hukum yang berlaku dalam Republik Indonesia

TAPAK SUCI PUTERA MUHAMMADIYAH, Ketua : H.EDDY JOENARKO,Amd.Kep.SH

Merupakan organisasi otonom yang , berakidah Islam dan bersumber Al-Qur'an dan Sunnah, berjiwa persaudaraan, dan merupakan perkumpulan dan perguruan seni bela diri. Tujuan didirikannya adalah sebagai berikut: Mendidik serta membina ketangkasan dan ketrampilan pencak silat sebagai seni bela diri Indonesia. Memelihara kemurnian pencak silat sebagai seni bela diri Indonesia yang sesuai dan tidak menyimpang dari ajaran Islam sebagai budaya bangsa yang luhur dan bermoral. Mendidik dan membina anggota untuk menjadi kader Muhammadiyah. Melalui seni bela diri menggembirakan dan mengamalkan dakmah amar ma'ruf nahi munkar dalam usaha mempertinggi ketahanan Nasional. Pencapaian maksud dan tujuan Tapak Suci tersebut dilakukan dengan upaya-upaya berikut: Memperteguh iman, menggembirakan dan memperkuat ibadah serta mempertinggi akhlaq yang mulia sesuai dengan ajaran Islam. Menyelenggarakan pembinaan dan pendidikan untuk melahirkan Kader Muhammadiyah. Menyelenggarakan pembinaan seni Beladiri Indonesia. Mengadakan penggalian dan penelitian Ilmu Seni Beladiri untuk meningkatkan dan mengernbangkan kemajuan Seni Beladiri Indonesia. Aktif dalam lembaga olahraga dan seni baik yang diadakan oleh Pemerintah maupun swasta yang tidak menyimpang dari maksud den tujuan Tapak Suci. Menggembirakan penyelenggaraan dakwah amar ma'ruf nahi munkar sesuai dengan proporsi seni beladiri. Menyelengaralam pertandingan dan lomba serta pertemuan untuk memperluas pengalaman dan persaudaraan. Menyelenggarakan usaha lain yang dapat mewujudkan tercapainya maksud dan tujuan.

HIZBUL WATHAN , Ketua HW Bontang :Drs.H.HAMDI ABDILLAH,M.M.

Merupakan organisasi otonom yang bergerak dibidang kepanduan, merupakan juga gerakan Islam, dan dakwah amar ma'ruf nahi munkar, beraqidah Islam, dan bersumber pada Al-Qur'an dan As-Sunnah. Tujuan didirikannya adalah mewujudkan masyarakat utama, adil, dan makmur yang diridhai Allah dengan jalan menegakkan dan menjunjung tinggi agama Islam lewat jalur pendidikan kepanduan, dengan upaya-upaya sebagai berikut: Melalui jalur kepanduan ingin meningkatkan pendidikan angkatan muda putra dan putri menurut ajaran Islam. Mendidik angkatan muda putra dan putri agar menjadi manusai muslim yang berakhlak mulia, berbudi luhur sehat jasmani dan rohani. Mendidik angkatan muda putra dan putri menjadi generasi yang taat beragama, berorganisasi. cerdas dan trampil. Mendidik generasi muda putra dan putri gemar beramal, amar makruf nahi munkar dan berlomba dalam kebajikan. Meningkatkan dan memajukan pendidikan dan pengajaran, kebudayaan serta memperluas ilmu pengetalman sesuai dengan ajaran agama Islam. Membentulc karakter dan kepribadian sehingga diharapkan menjadi kader pimpinan dan pelangsung amal usaha Muhammadiyah. Memantapkan persatuan dan kesatuan serta penanaman rasa demokrasi serta ukhuwah sehinga berguna bagi agama, nusa dan bangsa. Melaksanakan kegiatan lain yang sesuai dengan tujuan organisasi.